BIOMEDSCHOOL | Обучающие курсы для биологов и врачей

Нанопоровое секвенирование всё чаще появляется в лабораториях. Вместе с оборудованием приходят и новые вопросы: как работать с длинными прочтениями, какие инструменты использовать для анализа, какие вычислительные ресурсы нужны и можно ли разобраться в этом без большого опыта в биоинформатике. Чтобы ответить на самые частые вопросы, мы поговорили с Сергеем Евфратовым, преподавателем курса «Введение в биоинформатику нанопорового секвенирования» и специалистом научной поддержки по NGS и геномике к...

Многие исследователи мечтают о простом решении: отсеквенировать образец почвы, воды или ткани и сразу увидеть список всех патогенов. Кажется, что современные технологии сделают всё сами. И вот, вы отправляете образцы, ждете недели, платите за запуск... и получаете гигабайты сырых данных. Дальше сценария обычно два: 💻 Аутсорс-ловушка: Вы платите стороннему биоинформатику за разовый отчет. Но если данные грязные, вы просто получаете вердикт: «Ничего не вышло, ничего не видно». Деньги и время потр...

Пока коллеги гадают по кофейной гуще, вы будете хладнокровно использовать pod5 API и modkit. Что это такое? Сейчас расскажем! На пятом дне курса мы переходим к прямой работе с сырым сигналом в формате POD5 и инструменту Modkit. Современные алгоритмы позволяют отказаться от устаревшего и громоздкого fast5: новый формат POD5 оптимизирован для быстрой записи и параллельных вычислений, что критично при работе с высокопроизводительными ячейками. С помощью Modkit исследователь получает возможность ана...

День 3 на курсе посвящён одной из самых интересных задач в геномике — сборке бактериального генома de novo. Это этап, где из набора длинных прочтений постепенно складывается полноценная геномная последовательность организма. Рассказали весь в процесс в карточках! Кстати, сегодня последний день действия скидки1⃣0⃣% на курс! Если вы давно хотели разобраться в анализе данных нанопорового секвенирования и добавить биоинформатику к своим лабораторным навыкам, сейчас самый удобный момент присоединитьс...

Прежде всего, важное уточнение: мы не тратим время на обучение работе с кнопками конкретных приборов. Модели секвенаторов меняются, но принципы данных остаются прежними. Мы учим вас обрабатывать данные всех существующих нанопоровых систем — от портативного MinION до мощных PromethION и отечественного «Нанопоруса». Это универсальные знания, которые не имеют «срока годности» и не привязаны к конкретному бренду железа. Вы получите навыки, которые применимы в любой лаборатории мира. Ваш чемодан навы...

Мы проанализировали запросы наших студентов и выделили 4 типа специалистов, которым этот курс жизненно необходим. Узнаете себя? 1️⃣Человек-оркестр (самый частый сценарий) Вам в лабораторию купили секвенатор, но штатного биоинформатика не предусмотрено. Ваша задача: Самостоятельно научиться превращать сырые данные в отчеты, выполнять планы и не дать дорогому оборудованию покрыться пылью. 2️⃣Абсолютные новички в мире NGS Nanopore часто становится первым секвенатором в практике из-за низкого финанс...

Наш первый поток в ноябре показал: биомедики и нейросети — это мэтч. Страх перед кодом сменился азартом, и на горизонте уже второй поток. Пора настраиваться на рабочую волну! Курс AI Scientist предлагает не скучные лекции, а сообщество для тех, кто ценит эксперименты больше рутинных таблиц. Пройдем путь от основ до AlphaFold 2, ProteinMPNN и RFdiffusion. Научим писать статьи с ИИ, автоматизировать поиск и делать качественную визуализацию. И конечно, за алгоритмами стоят живые люди. Наши преподав...